Đây là một trong những nội dung quan trọng của kỳ họp, được các đại biểu Quốc hội, cử tri và dư luận xã hội rất quan tâm. Ngoài các câu hỏi chất vấn được trả lời bằng văn bản, chất vấn tại hội trường tập trung vào những vấn đề tầm vĩ mô được nhân dân quan tâm, những vấn đề bức xúc, nổi cộm hoặc những vấn đề đang cần phải thúc đẩy làm tốt hơn.

Bộ trưởng Bộ Tài chính - Vũ Văn Ninh trả lời về các vấn đề xung quanh điều hành ngân sách bao gồm lập dự toán, điều hành thu chi, giảm bội chi, chuyển nguồn, vấn đề nợ công, nợ quốc gia, nợ Chính phủ; về điều hành giá cả trong điều kiện đang chuyển sang thực hiện cơ chế thị trường hội nhập quốc tế, khi  nước ta cam kết tham gia tổ chức thương mại thế giới và các tổ chức kinh tế khác...
Bộ trưởng Bộ Giao thông Vận tải - Hồ Nghĩa Dũng trả lời các vấn đề về xây dựng hạ tầng giao thông; biện pháp để bảo đảm an toàn giao thông, các biện pháp chống ùn tắc.
Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn - Cao Đức Phát với các biện pháp đảm bảo cho nông dân trồng lúa có lãi trên 30% so với giá thành, đảm bảo thu nhập của nông dân sản xuất các loại cây trồng, vật nuôi khác; biện pháp hỗ trợ nông dân phòng, chống dịch bệnh trên cây trồng, vật nuôi; vấn đề cho các nhà đầu tư nước ngoài thuê đất trồng rừng; các biện pháp đảm bảo phát triển bền vững, lâu dài và công bằng của nông nghiệp, nông thôn trong đó có rà soát qui hoạch điều chỉnh cơ cấu đầu tư, bảo vệ đất nông nghiệp, phát triển thủy lợi, thích ứng với biến đổi khí hậu.
Bộ trưởng Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch - Hoàng Tuấn Anh với các vấn đề làm sao tiếp tục giữ gìn và phát huy cho được giá trị đạo đức truyền thống của dân tộc và bản sắc văn hóa dân tộc trong điều kiện phát triển kinh tế thị trường và mở cửa hội nhập; vấn đề tiết kiệm chống lãng phí của cải, tiền bạc, thời gian trong các lễ hội; xung quanh những di tích lịch sử, di sản văn hóa...

Ngày 12-6, Phó thủ tướng Thường trực Chính phủ Nguyễn Sinh Hùng, theo sự phân công của Thủ tướng đã báo cáo làm rõ thêm một số vấn đề chung liên quan đến việc điều hành của Chính phủ, trực tiếp trả lời chấn vấn của các đại biểu Quốc hội tập trung vào các nhóm vấn đề: Thực hiện mục tiêu ổn định kinh tế vĩ mô; Quan hệ giữa phát triển kinh tế với giải quyết các vấn đề xã hội; Quản lý, bảo vệ, khai thác tài nguyên, khoáng sản, môi trường; Dự án đường sắt cao tốc Hà Nội - thành phố Hồ Chí Minh; Đồ án quy hoạch chung thủ đô Hà Nội; Công tác chỉ đạo, điều hành của Chính phủ...

Như Lê