Nghị định quy định nếu không hoàn thành nhiệm vụ được giao hằng năm hoặc bị kỷ luật sẽ bị kéo dài thêm thời gian tính hưởng phụ cấp thâm niên vượt khung so với thời gian quy định. Cụ thể: Trường hợp không hoàn thành nhiệm vụ hoặc bị kỷ luật hình thức khiển trách hoặc cảnh cáo thì bị kéo dài thêm 6 tháng; bị kỷ luật giáng chức hoặc cách chức thì bị kéo dài thêm 12 tháng so với thời gian quy định.
Theo quy định cũ, các chức danh chuyên gia cao cấp, cán bộ, công chức trong các cơ quan nhà nước và đơn vị sự nghiệp nhà nước và đối tượng hưởng lương làm việc trong ngành tòa án, kiểm sát, nếu không hoàn thành nhiệm vụ được giao hằng năm hoặc bị kỷ luật thì thời gian nâng lương sẽ bị kéo dài thêm 12 tháng. Nay theo quy định mới, không hoàn thành nhiệm vụ hoặc bị kỷ luật hình thức khiển trách hoặc cảnh cáo thì kéo dài thêm 6 tháng; bị kỷ luật giáng chức hoặc cách chức thì kéo dài thêm 12 tháng so với quy định.
Đối với phụ cấp thâm niên nghề, sau 5 năm (đủ 60 tháng) tại ngũ hoặc làm việc liên tục trong ngành cơ yếu, hải quan, tòa án, kiểm sát, kiểm toán, thanh tra, thi hành án dân sự, kiểm lâm thì được hưởng phụ cấp thâm niên nghề bằng 5% mức lương hiện hưởng cộng phụ cấp chức vụ lãnh đạo và phụ cấp thâm niên vượt khung; từ năm thứ 6 trở đi mỗi năm được tính thêm 1%. Trước đây, quy định này chỉ áp dụng đối với ngành hải quan và cơ yếu, nay đã mở rộng thêm đối tượng thụ hưởng. Nghị định cũng bổ sung hệ số phụ cấp chức vụ lãnh đạo đối với các chức danh lãnh đạo thuộc UBND thành phố thuộc tỉnh là đô thị cấp I, cụ thể: Chủ tịch UBND có hệ số phụ cấp chức vụ là 0,95; Phó Chủ tịch UBND là 0,75; Chánh Văn phòng, Trưởng phòng cơ quan chuyên môn thuộc UBND là 0,50 và Phó Chánh Văn phòng, Phó trưởng phòng cơ quan chuyên môn thuộc UBND có phụ cấp chức vụ là 0,30. Thủ trưởng cơ quan thi hành án dân sự thành phố thuộc tỉnh là đô thị loại I phụ cấp chức vụ là 0,50; Phó Thủ trưởng cơ quan thi hành án dân sự thành phố thuộc tỉnh là đô thị loại I là 0,40; Chánh thanh tra thành phố thuộc tỉnh là đô thị loại I có hệ số phụ cấp là 0,50 và Phó Chánh thanh tra thành phố thuộc tỉnh là đô thị loại I có hệ số phụ cấp chức danh lãnh đạo là 0,40.
Nghị định cũng sửa đổi phụ cấp chức vụ lãnh đạo đối với chức danh Tư lệnh Quân khu từ 1,20 lên 1,25.